確定申告の期限を過ぎてしまったら？まだ間に合います

2026年3月16日以降にこの記事を読んでいるとしても、ご安心ください。まだ申告できます。日本では期限後申告が認められており、迅速に対応すれば、ペナルティは少額で済んだり、あるいはゼロになる場合もあります。このガイドでは、今すぐ取るべき具体的な行動に加え、2025年（令和7年）分の所得について初めて申告する方のために、e-Taxでの申告手順をすべて網羅しています。

この記事は、2025年（令和7年）分の所得（2025年1月1日から12月31日までに得た所得）に対する2026年の申告期間についてご案内しています。

期限を過ぎてしまったら？期限後申告の方法

2026年3月16日までに申告できなかった場合、期限後申告を行う必要があります。国税庁は、申告を忘れてしまった場合でも、気付いた時点で速やかに申告書を提出するよう促しています。

期限後申告の方法（通常と同様の手続き）

このガイドで説明されているe-Taxシステムまたは書面での手続きと同様の方法で行います。国税庁の確定申告書等作成コーナーは、3月16日を過ぎても年中利用可能です。申告書を作成し、e-Taxで提出するか税務署に郵送し、提出後速やかに納税してください。

期限後申告のペナルティ：発生する可能性のある費用

期限後申告の場合、追加で課される可能性がある課徴金は2種類あります。

1. 無申告加算税

これは、納税額に上乗せされる一回限りのペナルティです。税率は、いつ申告するか、そして誰によって発見されるかによって異なります。

• 国税庁から指摘を受ける前に自主的に申告した場合：納税額の5%。
• 国税庁が事前通知（実地調査前）を送付した後に申告した場合：50万円までの部分には10%、50万円を超え300万円までの部分には15%、300万円を超える部分には25%。
• 税務調査後に申告した場合：50万円までの部分には15%、50万円を超え300万円までの部分には20%、300万円を超える部分には30%。

2. 延滞税

これは、未納の税金に対する利息に相当するもので、当初の期限の翌日から納付日まで日割りで計算されます。2025年（令和7年）分の所得に対する税率は以下の通りです。

• 期限後2ヶ月以内：年率2.8%（2026年1月1日～12月31日）
• 2ヶ月経過後：年率9.1%（2026年1月1日～12月31日）

これらの税率は毎年設定されます。

還付申告のみの場合は？

もし、還付申告のみを行う場合（例えば、源泉徴収で過払いが発生した場合など）は、期限後申告に対するペナルティはありません。国税庁は、税金が課される年の翌年1月1日から5年間は還付請求が可能であると説明しています。2025年分の所得については、2030年末まで還付申告が可能です。

始める前に：課税年度、居住者区分、主要な日本語用語

e-Taxに触れる前に、基本事項を正しく把握してください：課税年度、あなたの居住者区分、そして申告画面で目にするいくつかの重要な日本語用語です。

課税年度と2026年の申告期間

日本の所得税の課税年度は常に1月1日から12月31日です。今回の申告では、2025年（令和7年）に得た所得を申告します。

国税庁（NTA）は毎年申告期間を発表しています。令和7年（2025年）分の所得に対する申告期間は、2026年2月16日（月）から2026年3月16日（月）までです。

居住者区分（外国人が知っておくべき理由）

納税義務は、日本であなたが税法上の居住者とみなされるか、非居住者とみなされるかによって大きく変わります。

国税庁は、日本に住所があるか、または引き続き1年以上居所を有していない限り、あなたは非居住者とみなされると説明しています。非居住者は、原則として国内源泉所得のみが課税対象となります。

多くの駐在員は、非永住者（NPR）という言葉も耳にします。一般的に、専門家による要約では、過去10年以内に日本に滞在した期間が通算して5年以内である外国人とされています。これは、一部の国外源泉所得の課税方法に影響を与える可能性があります。

重要：非永住者のルールは複雑になる場合があります（特に海外所得や送金が関わる場合）。このガイドを参考に自信を持って申告を進めてください。ただし、海外投資、海外給与、または複雑な国際的な状況がある場合は、ご自身の状況について確認することをお勧めします。

最低限必要な日本語（用語集）

申告書作成画面のほとんどは日本語なので、主要な表示を把握しておくと時間が節約できます。（国税庁でさえ、オンラインの「申告手続案内・申告書作成」に関する説明は日本語のみであると述べています。）

• 確定申告（かくていしんこく）
• 確定申告書等作成コーナー（かくていしんこくしょとうさくせいコーナー）
• e-Tax（イータックス）
• マイナンバーカード（マイナンバーカード）
• マイナポータル連携（マイナポータルれんけい）
• 源泉徴収票（げんせんちょうしゅうひょう）
• 控除（こうじょ）
• 還付（かんぷ）
• 納付（のうふ）
• 期限後申告（きげんごしんこく）
• 無申告加算税（むしんこくかさんぜい）
• 延滞税（えんたいぜい）

申告の必要性：外国居住者によくあるケース

まず、以下の点をご確認ください。ほとんどの「判断に迷う」状況は、(1)給与所得と年末調整、(2)副収入、(3)フリーランス／事業所得を整理することで明確になります。

判断フロー（初心者向け）

1. 日本に雇用主が1社ある従業員ですか？

   • 通常はいいえ：ほとんどの給与所得者は、所得税が年末調整によって精算されるため、申告する必要がありません。
   • ただし、以下の「申告が必要なケース」に該当する場合ははい。

2. 副収入や「その他の所得」がありますか？（フリーランスの仕事、海外所得、オンライン販売、暗号資産の利益、賃貸収入など）

   • 雇用所得と退職所得を除く、総所得が20万円を超える場合は、その多くは該当します。

3. 主に日本でフリーランス／個人事業主として活動していますか？

   • その場合は、ほぼ必ず該当します（ご自身で所得税を計算・納税する責任があり、確定申告はそのための手続きとなります）。

4. 日本を離れる（またはすでに離れた）が、まだ税金の精算が必要ですか？

   • はい、事前に計画を立てる必要があります：日本に納税管理人を選任する必要があるか、出国前に申告・納税（準確定申告）が必要な場合があります。

従業員：最も一般的な「申告義務」のトリガー

もしあなたが給与所得者であれば、以下の項目は国税庁が示す、給与所得者が確定申告を行う必要がある主なケースです。

• 給与所得が2,000万円を超える場合。
• 20万円を超えるその他の所得がある場合（雇用所得および退職所得を除く）。
• 2社以上の会社から給与を受けており、主たる給与以外の給与所得とその他の所得の合計が20万円を超える場合。

「その他の所得」が何に当たるか不明な場合は、再確認するか（国税庁の相談センターや税理士に問い合わせるなど）、確認することをお勧めします。

申告義務がなくても、申告した方が良い場合（還付申告）

還付を受けるためだけに申告書を提出することもできます（例えば、源泉徴収が多すぎた場合など）。国税庁は、税金が課される年の翌年1月1日から5年間還付請求が可能であると説明しています。

これは、年度途中で仕事を辞めて年末調整を受けられなかった外国人や、医療費控除や寄付金控除などを申請する人によく見られるケースです。

申告方法：e-Taxオンライン（スマホ／PC）

2026年現在、ほとんどの外国人にとって最も簡単な方法は、国税庁のオンライン作成ツールを使用し、e-Taxで提出し、可能であればマイナポータル連携を利用して書類を自動入力することです。この手続きは、期限内に申告する場合でも、期限後申告の場合でも同じです。

ステップ0：ログイン／提出方法の選択（マイナンバーカード方式 vs ID・パスワード方式）

e-Taxで個人が提出する方法は、大きく分けて2つあります。

• マイナンバーカード方式：ほとんどの人にとって標準的な方法であり、マイナポータル連携をスムーズに行うために必要です。
• ID・パスワード方式：すでに本人確認済みの方のための簡易的な方法です。

2026年に関する重要な更新：e-Taxヘルプデスクによると、国税庁は2025年10月1日以降、新規のID・パスワードの発行を停止しました。もしすでに持っていないのであれば、現在ID・パスワード方式で始めることは一般的にできません。マイナンバーカードを使用する計画を立ててください。

e-Taxサイトでは、ID・パスワード方式は暫定的な措置であり、確定申告書等作成コーナーからの申告に限られると説明しています。

ステップ1：必要なものの準備（外国人向けチェックリスト）

始める前に、これらを集めてください。日本語があまり読めない場合は、雇用主／保険会社に正確な書類名を尋ねると役立ちます。

• マイナンバーカード（現物）とPIN（マイナンバーカード方式を使用する場合）
• 雇用主からの書類：2025年分の源泉徴収票、および会社が提供する追加の明細書
• 控除証明書（一般的な例）：
  • 生命保険料・地震保険料控除証明書（保険会社から）
  • 国民年金・社会保険料の証明書（発行元から）
  • ふるさと納税の寄付金受領証明書／領収書（自治体またはプラットフォームから）
  • 医療費の合計額（または医療費通知情報）
• 還付用銀行口座情報（カタカナでの口座名義が要求されることが多い）
• フリーランスの場合：2025年分の収入記録および経費記録（領収書、請求書、集計表）

ステップ2：公式の申告ツールへアクセス

国税庁の確定申告書等作成コーナーを利用し、ガイドに従って質問に答え、正しい申告書を作成します。

• 確定申告書等作成コーナー (keisan.nta.go.jp)
• e-Taxポータル (e-tax.nta.go.jp)

電子申告（e-Tax）で提出することも、印刷して郵送することも可能で、国税庁は還付申告のガイダンスでこのワークフローを説明しています。

ステップ3：スマートフォンでの手順（期待できること）

スマートフォンで申告したい場合、e-Taxヘルプデスクはスマートフォン用マニュアルを提示しており、手順は（a）税の種類、（b）提出方法、および（c）マイナポータル連携を使用するかどうかによって異なると示しています。

1. 確定申告書等作成コーナーを開き、作成開始をタップします。
2. 課税年度を選択します（今期は：令和7年／2025年分所得）。
3. 提出方法：e-Taxを選択します。
4. 方式を選択します：
   • マイナンバーカード方式、または
   • ID・パスワード方式（すでに持っている場合のみ）
5. 促された場合、マイナポータル連携を使用して書類を自動インポートするかどうかを選択します。
6. 収入を入力し、次に控除を入力し、還付／納税額を確認した後、提出します。
7. 提出後、受信通知とダウンロードしたPDFを保存してください。

ステップ4：マイナポータル連携で作業を効率化（書類の自動インポート）

マイナポータル連携を利用すれば、対象となる証明書をインポートし、適切な控除項目に自動入力することで、手動での日本語データ入力の手間を減らすことができます。

国税庁は、所得税申告書に自動インポートできるものの例を挙げています。これには以下が含まれます。

• 医療費通知情報
• 寄附金受領証明書・寄附金控除に関する証明書（ふるさと納税など）
• 保険料控除証明書（生命保険や地震保険など）
• 利用可能な場合の源泉徴収票情報

国税庁のマイナポータル連携のページで、対象となる「控除証明書等」の最新リストや、時期／対応に関する注意事項を確認してください（一部の項目は特定の日付以降に利用可能になります）。

ステップ5：困ったとき（公式ヘルプ）

公式のガイダンスが必要な場合、国税庁は全国的な相談窓口を提供しています。

• 国税相談専用ダイヤル（日本国内）：0570-00-5901
• 音声ガイダンスに従ってください（個人の確定申告に関する質問の場合、指示された個人申告に関する問い合わせのオプションを選択）。
• 通常時間：平日9:00～17:00（土日祝日、年末年始は休業）

その番号に電話できない場合（例えば、「050」から始まる一部のIP電話など）、国税庁は、管轄の税務署の代表番号に電話し、ガイダンスに従って接続できると説明しています。

控除、還付、そして提出後

ここは、多くの外国人が（a）還付金を受け取るか、あるいは（b）本来受け取れるはずのお金を見過ごしてしまう場所です。以下に、最も一般的な控除と、e-Tax提出後にすべきこと、そして日本を離れる場合について説明します。

医療費控除：主要な数値

ご自身または扶養している家族のために医療費を支払った場合、医療費控除を申請できる可能性があります。

国税庁は、控除額が概ね次のように計算されると述べています。（支払った医療費 － 補填された金額）－ 10万円（または総所得が200万円未満の場合は総所得の5%）、控除の上限は200万円です。

書類の原則：通常、医療費控除の明細書を添付する必要があります。領収書は通常添付する必要はありませんが、国税庁は、税務署からの要求があった場合に備え、通常5年間保管する必要があると説明しています。

セルフメディケーション税制：もう一つの選択肢

通常の医療費控除の対象とならない（または恩恵を受けられない）場合、対象となるOTC医薬品の購入に対する代替制度があります。

国税庁は、この制度が通常の医療費控除とは併用できないと説明しており、対象となる購入額が1万2千円を超え、8万8千円を上限として適用されます。この制度は2017年1月1日から2026年12月31日までの購入に利用できます。

ふるさと納税：寄付金控除とワンストップ特例の注意点

ふるさと納税は、2,000円を超える部分について所得税と住民税の寄付金控除の対象となります。

外国人に非常によくある間違い：もしワンストップ特例制度を利用しているにもかかわらず、最終的に確定申告をする場合（例えば、医療費や副収入のためなど）、国税庁はワンストップの申請が無効になると述べています。その場合は、それらの寄付を確定申告書に含め、控除を適切に計算する必要があります。

生命保険料控除：保険会社に何を尋ねるべきか

生命保険、介護医療保険、個人年金保険の保険料を支払った場合、保険会社に生命保険料控除証明書を請求してください。確定申告書等作成コーナーは、入力／インポートした情報に基づいて控除額を計算できます。

国税庁のガイダンスでは、控除はカテゴリ（新契約／旧契約および保険の種類）ごとに計算され、生命保険料控除の合計額には上限があること（作成ガイダンスでは一般的に12万円が上限とされている）が示されています。

国外居住親族の扶養控除：本国への送金

本国の家族に送金している場合、その家族に対して扶養控除を申告できる可能性があります。これにより、扶養親族一人あたり最大で所得税38万円から63万円の課税所得を減らすことができ、さらに住民税の控除も別途適用されます。

対象となるのは？国外居住親族は以下の条件を満たす必要があります。

• 6親等以内の親族であること（両親、兄弟姉妹、祖父母、叔父／叔母など）
• 年間所得が58万円以下であること（令和7年分の所得以降は48万円から改定）
• あなたによって経済的に扶養されていること

重要：2023年のルール変更（引き続き適用）：2023年（令和5年）以降、国外に居住する30歳から69歳までの扶養親族には、より厳しい条件が課せられます。以下の3つの条件のいずれかを満たす場合にのみ、扶養控除の対象となります。

1. 留学中であること（海外留学のために日本を離れた）
2. 障害があること
3. 生計費または教育費として、年間を通じてあなたから38万円以上の送金を受けていること

本国の両親や兄弟姉妹に送金しているほとんどの外国人労働者にとって、条件3が主な道筋となります。家族が30歳から69歳の場合、年間で少なくとも38万円を送金したことを証明する必要があります。

30歳未満または70歳以上の扶養親族には、これらの追加条件は適用されません。

必要な書類（2種類）：

• 親族関係書類 — 出生証明書、戸籍謄本、または本国政府発行の書類（日本語訳を添付）
• 送金関係書類 — あなたが特定の人物に送金したことを証明する銀行または送金サービスの領収書。その年のすべての送金領収書を保管してください。（3回以上の送金があった場合、送金の一覧表と最初と最後の領収書を提出することも可能です。）

2026年「令和7年分所得」に関する更新：基礎控除の変更点

2026年に2025年（令和7年）分の所得を申告する場合、国税庁の基礎控除表に、令和7年以降の所得帯別の控除額改定が示されていることに注意してください。これには、低所得者層向けの基礎控除額の増額（例えば、基礎控除が95万円となる所得帯など）が含まれています。

同じ国税庁のページには、非居住者の場合、基礎控除の最大額が58万円であることも記されています。

還付金：いつ支払われるか、どこまで遡って請求できるか

源泉徴収額が多すぎた場合（または控除／税額控除を申告する場合）、提出後に還付金を受け取れることがあります。還付金は通常、申告書に登録した銀行口座に振り込まれます。

法的に申告義務がなかった場合でも、国税庁は還付申告が可能であり、税金が課される年の翌年1月1日から5年間還付請求が可能であると説明しています。

提出後：保管すべきもの、修正すべきこと、日本を離れる場合

記録を保管してください：医療費控除のような一部の控除では、書類を何年間も保管する必要がある場合があります。保管期間を満たしたと確信するまで、領収書や証明書を捨てないでください。

間違いに気づいたら：慌てないでください。日本には申告を修正する手続きがありますが、取るべき行動は過少申告か過大申告かによって異なります。

日本を離れる場合：国税庁は、日本を離れて税法上の居住者資格を失うが、なお申告／納税手続きを行う必要がある場合、通常、日本に納税管理人を選任し、必要な届出を提出する必要があると説明しています。納税管理人を選任せずに日本を離れる場合、通常、準確定申告を行い、出国前に納税する必要があります。

よくある「外国人特有の状況」（簡単なメモ）

• 短期滞在／非居住者：国税庁は非居住者の定義（日本に住所がなく、引き続き1年以上居所を有していない）を定め、非居住者は国内源泉所得に課税されると説明しています。
• 日本での勤務中に海外から給与を受け取った場合：国税庁は、非居住者として分類された外国人従業員が日本で勤務しているものの、日本の源泉徴収なしで本国から給与を受け取っている場合、準確定申告と出国前の納税が必要となることがあると例示しています。
• 非永住者（NPR）の認識：日本には一部の外国居住者に対して特別な非永住者制度があり、専門的な要約では「過去10年以内に通算して5年以内」という目安が一般的に使われますが、所得の種類や資金の動き方によって実際の税務上の扱いは異なる場合があります。

よくある質問（2026年に申告する外国人向け）

Q: 日本に勤務先が1社しかありません。確定申告は必要ですか？
A: 通常は不要です。ほとんどの給与所得者は年末調整で対応されます。しかし、国税庁の定める条件（例えば、給与所得が多額、または20万円を超えるその他の所得がある場合など）に該当する場合は申告が必要です。

Q: 確定申告はスマートフォンだけでできますか？
A: はい、できます。e-Taxヘルプデスクはスマートフォンでの申告手順やマニュアルを提供しており、マイナポータル連携を使用するかどうかや提出方法によって手順が異なります。

Q: 2026年からID・パスワード方式を新たに使い始めることはできますか？
A: もしすでにお持ちでなければ、おそらくできません。国税庁は2025年10月1日以降、ID・パスワードの新規発行を停止しました。

Q: ふるさと納税をワンストップ特例でしましたが、それでも確定申告をした場合はどうなりますか？
A: 確定申告をした場合、ワンストップ特例は無効になりますので、寄付金は確定申告書に含めて適切に寄付金控除を計算する必要があります。

Q: 海外の家族に送金しています。税金控除を受けられますか？
A: はい、受けられます。家族が扶養親族の条件を満たす場合（低所得で、あなたが扶養している場合）。親族関係と送金領収書の証明が必要です。注：2023年以降、30～69歳の扶養親族は追加条件（例：年間38万円以上の送金を受けていること）を満たす必要があります。

Q: もうすぐ日本を離れます。税金について一番覚えておくべきことは何ですか？
A: 日本に納税管理人を選任するかどうかを決めてください。もし納税管理人を選任せずに日本を離れるが、それでも申告義務がある場合、出国前に準確定申告と納税が必要となることがあります。

Q: 3月16日の期限を過ぎてしまいました。問題になりますか？
A: 迅速に対応すれば問題ありません。e-Taxまたは税務署でできるだけ早く申告してください。1ヶ月以内に自主的に申告し、全額納税すれば、無申告加算税は全額免除される可能性があります。その期間を過ぎた場合でも、国税庁から連絡が来る前に自主的に申告すれば、ペナルティはわずか5%にとどまります。

Q: 還付を受けるためだけに申告しています。期限を過ぎてもペナルティはありますか？
A: いいえ、ありません。還付申告のみの場合は、期限後申告に対するペナルティはありません。課税年度の翌年1月1日から5年間、還付を請求できます。

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